演进思考

从架构维护视角看仓库的当前形态和演进方向。

当前形态

MICOS-2024 包含：

• 一个相对清晰的稳定 CLI 核心
• 更大范围的脚本和模板
• 一批环境和工作流资产

值得保留的优点

1. 面向宏基因组分析的领域聚焦明确
2. 通过工作流与容器资产表达了可重现性姿态
3. 稳定 CLI 面足够收敛

值得管理的风险

1. 模板范围可能先于稳定执行面收敛
2. 包装层如果不持续收缩，容易再次漂移
3. 专家脚本会让外部读者误以为稳定公共面比真实更大

健康的下一步

• 把稳定能力继续往 Python CLI 主链路收敛
• 让包装脚本始终只做委托
• 为脚本层分析明确标注实验性或专家向
• 围绕配置默认值继续增强验证