MICOS-2024宏基因组分析平台

串联质控、物种分类、多样性分析和功能注释的一站式 Python CLI

质量控制

FastQC 评估 + KneadData 宿主去除

物种分类

Kraken2 分类 + kraken-biom 转换 + Krona 可视化

多样性分析

QIIME2 计算 Shannon Alpha 和 Bray-Curtis Beta 多样性

功能注释

HUMAnN 基因家族和代谢通路丰度

结果汇总

自动生成 HTML 结果索引报告

可重现部署

WDL 工作流资产 + Singularity 容器定义