常见问题

MICOS-2024 是 workflow engine 吗

不是。它是一个围绕宏基因组工具栈构建的 CLI 平台，同时包含 steps/ 下的 WDL 工作流资产和 containers/ 下的环境资产。

`scripts/` 里的所有脚本都属于稳定公共接口吗

不是。很多脚本是专家扩展或探索性能力。稳定的命令面请看 CLI 参考。

新项目应该优先用包装脚本还是 Python CLI

优先用 Python CLI。包装脚本适合兼容旧工作流，但不是新项目的事实标准。

为什么配置模板看起来比 CLI 大很多

模板反映的是更大的平台视野（包括 scripts/ 下的扩展分析），而当前稳定 CLI 只覆盖主链路。

从哪里开始了解项目

建议顺序：